تستكشف تايوان فرص التعاون في صناعات الشحن ، ومعالجة المعادن ، وتكنولوجيا المعلومات والاتصالات والمدينة الذكية وتكنولوجيا المكونات الغذائية مع إندونيسيا. فقد قال المدير العام للمرونة والتنمية في الوصول الصناعي الدولي غوستي إ فوتو سوياويراوان من خلال بيانه الصادر في جاكرتا يوم الخميس ان الميزان التجاري في اندونيسيا كان فائضا لصالح تايوان. مع ذلك ، لا يزال من الممكن تحسين الميزان التجاري في إندونيسيا من خلال تحسين الموارد الصناعية.
ففي عام 2017 ، بلغ إجمالي التجارة بين البلدين 7.4 مليار دولار أمريكي واحتلت تايوان المرتبة 11 كشريك عالمي في الاستيراد والتصدير لإندونيسيا. و من ناحية اخرى ، بلغ اجمالى الاستثمارات المباشرة لاندونيسيا فى تايوان 32.2 مليار دولار امريكى. بينما يبلغ الاستثمار المباشر لتايوان في إندونيسيا حوالي 397 مليون دولار أمريكي. و تايوان هي أكبر مستثمر في إندونيسيا. فيما أضاف بوتو أنه تم تشجيع رجال الاعمال التايوانيين في الصناعة على الاستمرار و زيادة استثماراتهم مع إقامة شراكات مع رجال الأعمال في إندونيسيا بحيث يتوقع أن تصبح إندونيسيا قاعدة إنتاج لكل من الأسواق المحلية والدولية.